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using System.Diagnostics;
using System.Text.Encodings.Web;
using System.Text.Json;
using System.Text.Unicode;
using System.Globalization;
using CsvHelper;
using CsvHelper.Configuration;
using System.CommandLine;
using System.Text;
/// <summary>
/// Classe principale du programme.
/// </summary>
public class Program
{
/// <summary>
/// Options pour le sérialiseur JSON.
/// </summary>
public static JsonSerializerOptions jsonSerializerOptions = new JsonSerializerOptions
{
WriteIndented = true,
Encoder = JavaScriptEncoder.Create(UnicodeRanges.All)
};
/// <summary>
/// Nom du fichier contenant les données de base des médicaments.
/// </summary>
const string CIS_bdpm = "CIS_bdpm";
/// <summary>
/// Nom du fichier contenant les données de composition des médicaments.
/// </summary>
const string CIS_COMPO_bdpm = "CIS_COMPO_bdpm";
/// <summary>
/// Nom du fichier contenant les données de présentation des médicaments.
/// </summary>
const string CIS_CIP_bdpm = "CIS_CIP_bdpm";
/// <summary>
/// Nom du fichier contenant les données des groupes génériques.
/// </summary>
const string CIS_GENER_bdpm = "CIS_GENER_bdpm";
/// <summary>
/// Nom du fichier contenant les données des avis SMR de la HAS.
/// </summary>
const string CIS_HAS_SMR_bdpm = "CIS_HAS_SMR_bdpm";
/// <summary>
/// Nom du fichier contenant les données des avis ASMR de la HAS.
/// </summary>
const string CIS_HAS_ASMR_bdpm = "CIS_HAS_ASMR_bdpm";
/// <summary>
/// Nom du fichier contenant les informations importantes.
/// </summary>
const string CIS_InfoImportantes = "CIS_InfoImportantes";
/// <summary>
/// Nom du fichier contenant les conditions de prescription et de délivrance.
/// </summary>
const string CIS_CPD_bdpm = "CIS_CPD_bdpm";
/// <summary>
/// Nom du fichier contenant les liens vers les avis de la Commission de la transparence.
/// </summary>
const string HAS_LiensPageCT_bdpm = "HAS_LiensPageCT_bdpm";
/// <summary>
/// Nom du fichier contenant les données de disposition spéciale.
/// </summary>
const string CIS_CIP_Dispo_Spec = "CIS_CIP_Dispo_Spec";
/// <summary>
/// Liste pour stocker les données des médicaments.
/// </summary>
static List<Medication> medications = new List<Medication>();
/// <summary>
/// Liste pour stocker les données de composition des médicaments.
/// </summary>
static List<MedicationComposition> medicationCompositions = new List<MedicationComposition>();
/// <summary>
/// Liste pour stocker les données de présentation des médicaments.
/// </summary>
static List<MedicationPresentation> medicationPresentations = new List<MedicationPresentation>();
/// <summary>
/// Liste pour stocker les données des groupes génériques.
/// </summary>
static List<GenericGroup> genericGroups = new List<GenericGroup>();
/// <summary>
/// Liste pour stocker les données des avis SMR de la HAS.
/// </summary>
static List<HasSmrOpinion> hasSmrOpinions = new List<HasSmrOpinion>();
/// <summary>
/// Liste pour stocker les données des avis ASMR de la HAS.
/// </summary>
static List<HasAsmrOpinion> hasAsmrOpinions = new List<HasAsmrOpinion>();
/// <summary>
/// Liste pour stocker les informations importantes.
/// </summary>
static List<ImportantInformation> importantInformations = new List<ImportantInformation>();
/// <summary>
/// Liste pour stocker les conditions de prescription et de délivrance.
/// </summary>
static List<PrescriptionDispensingConditions> prescriptionDispensingConditions = new List<PrescriptionDispensingConditions>();
/// <summary>
/// Liste pour stocker les liens vers les avis de la Commission de la transparence.
/// </summary>
static List<TransparencyCommissionOpinionLinks> transparencyCommissionOpinionLinks = new List<TransparencyCommissionOpinionLinks>();
/// <summary>
/// Liste pour stocker les spécialités pharmaceutiques.
/// </summary>
static List<PharmaceuticalSpecialty> pharmaceuticalSpecialties = new List<PharmaceuticalSpecialty>();
/// <summary>
/// Point d'entrée principal de l'application.
/// </summary>
/// <param name="args">Arguments de la ligne de commande.</param>
/// <returns>Code de sortie de l'application.</returns>
public static async Task<int> Main(string[] args)
{
// Initialisation du chronomètre pour mesurer le temps d'exécution.
Stopwatch stopwatch = new Stopwatch();
stopwatch.Start();
// Options de la ligne de commande.
var modelOption = new Option<string>(
new string[] { "--model", "-m" },
description: "Modèle à utiliser : ai ou dataset ou database"
);
var datasetOption = new Option<string[]>(
new string[] { "--dataset", "-d" },
description: "Jeu de données à utiliser : CIS_bdpm, CIS_COMPO_bdpm, CIS_CIP_bdpm, CIS_GENER_bdpm, CIS_HAS_SMR_bdpm, CIS_HAS_ASMR_bdpm, CIS_InfoImportantes, CIS_CPD_bdpm, HAS_LiensPageCT_bdpm, CIS_CIP_Dispo_Spec, all"
);
var mergeOption = new Option<bool>(
new string[] { "--merge" },
description: "Fusionner les jeux de données"
);
var outputDirOption = new Option<DirectoryInfo>(
new string[] { "--outputDir", "-o" },
description: "Répertoire de sortie"
);
var outputUrlOption = new Option<Uri>(
new string[] { "--outputUrl", "-u" },
description: "URL de sortie"
);
var outputNameOption = new Option<FileInfo>(
new string[] { "--outputName", "-n" },
description: "Nom du fichier de sortie"
);
var sentenceCountOption = new Option<int>(
new string[] { "--sentenceCount", "-s" },
description: "Nombre de phrases à générer"
);
var inputOption = new Option<FileInfo>(
new string[] { "--input", "-i" },
description: "Fichier d'entrée"
);
// Commande principale.
var rootCommand = new RootCommand("MedicAppToolsDatasets")
{
modelOption,
datasetOption,
mergeOption,
outputDirOption,
outputUrlOption,
sentenceCountOption,
inputOption,
outputNameOption
};
// Définition du gestionnaire de la commande.
rootCommand.SetHandler(async (model, datasetInput, merge, outputDir, outputUrl, sentenceCount, inputDir, outputName) =>
{
try
{
string[] dataset = new string[] {
CIS_bdpm,
CIS_COMPO_bdpm,
CIS_CIP_bdpm,
CIS_GENER_bdpm,
CIS_HAS_SMR_bdpm,
CIS_HAS_ASMR_bdpm,
CIS_InfoImportantes,
CIS_CPD_bdpm,
HAS_LiensPageCT_bdpm,
CIS_CIP_Dispo_Spec
};
// Validation des arguments de la ligne de commande.
if (model == "ai")
{
if (datasetInput.Length > 0)
{
throw new Exception("Dataset is not required for model ai");
}
if (sentenceCount == 0)
{
throw new Exception("Sentence count is required for model ai");
}
if (inputDir == null)
{
throw new Exception("Input file is required for model ai");
}
else if (!inputDir.Exists)
{
throw new Exception("Input file does not exist");
}
else if (File.ReadAllLines(inputDir.FullName).Length < 1)
{
throw new Exception("Input file contains empty lines");
}
if (outputDir == null && outputUrl == null)
{
throw new Exception("Output directory or output URL is required for model ai");
}
else if (outputDir != null)
{
if (!outputDir.Exists)
{
outputDir.Create();
}
}
else if (outputUrl != null)
{
if (!outputUrl.IsWellFormedOriginalString())
{
throw new Exception("Output URL is not well formed");
}
}
if (outputDir != null && outputName == null)
{
throw new Exception("Output name is required for model ai");
}
}
else if (model == "dataset")
{
if (datasetInput == null)
{
throw new Exception("Dataset is required for model dataset");
}
else
{
if (!datasetInput.Contains("all"))
{
dataset = dataset.Where(d => datasetInput.Contains(d)).ToArray();
if (dataset.Length == 0)
{
throw new Exception("Dataset is required for model dataset");
}
}
}
if (outputDir == null && outputUrl == null)
{
throw new Exception("Output directory or output URL is required for model dataset");
}
else if (outputDir != null)
{
if (!outputDir.Exists)
{
outputDir.Create();
}
}
else if (outputUrl != null)
{
if (!outputUrl.IsWellFormedOriginalString())
{
throw new Exception("Output URL is not well formed");
}
}
}
else if (model == "database")
{
if (datasetInput.Length > 0)
{
throw new Exception("Dataset is not required for model database");
}
if (outputDir == null)
{
throw new Exception("Output directory is required for model database");
}
else if (!outputDir.Exists)
{
outputDir.Create();
}
if (outputName == null)
{
throw new Exception("Output name is required for model database");
}
}
else
{
throw new Exception("Unknown model");
}
// Téléchargement et conversion des jeux de données.
await DownloadAndConvert(dataset.ToList());
// Traitement en fonction du modèle et des options spécifiées.
if (model == "ai")
{
Merge();
List<SentenceData> sentences = MakeIAModel(sentenceCount, inputDir);
if (outputDir != null)
{
await SaveAsJsonAsync(sentences, outputDir, outputName);
}
else if (outputUrl != null)
{
await UploadJsonAsync(sentences, outputUrl);
}
}
else if (model == "dataset")
{
if (merge)
{
Merge();
if (outputDir != null)
{
await SaveAsJsonAsync(medications, outputDir, new FileInfo("merged_" + CIS_bdpm));
}
else if (outputUrl != null)
{
await UploadJsonAsync(medications, outputUrl);
}
}
else
{
if (outputDir != null)
{
await SaveDatasets(dataset.ToList(), outputDir);
}
else if (outputUrl != null)
{
await UploadDatasets(dataset.ToList(), outputUrl);
}
}
}
else if (model == "database")
{
Merge();
if (outputDir != null && outputName != null)
{
var path = Path.Join(outputDir.FullName, outputName.Name);
var file = new FileInfo(path);
if (file.Exists)
{
file.Delete();
}
using (var context = new MedicationContext(path))
{
context.Database.EnsureDeleted();
context.Database.EnsureCreated();
context.Medications.AddRange(medications);
context.SaveChanges();
}
}
}
}
catch (Exception ex)
{
Console.WriteLine(ex.Message);
}
// Arrêt du chronomètre et affichage du temps d'exécution.
stopwatch.Stop();
Console.WriteLine($"Temps d'exécution: {stopwatch.ElapsedMilliseconds} ms");
}, modelOption, datasetOption, mergeOption, outputDirOption, outputUrlOption, sentenceCountOption, inputOption, outputNameOption);
// Invocation de la commande avec les arguments de la ligne de commande.
return await rootCommand.InvokeAsync(args);
}
/// <summary>
/// Télécharge et convertit les jeux de données spécifiés.
/// </summary>
/// <param name="datasets">Liste des jeux de données à télécharger et convertir.</param>
public static async Task DownloadAndConvert(List<string> datasets)
{
// Initialisation des tâches pour chaque type de données.
List<Task> tasks = new List<Task>();
Task<List<Medication>> medicationsTask = Task.FromResult(new List<Medication>());
Task<List<MedicationComposition>> medicationCompositionsTask = Task.FromResult(new List<MedicationComposition>());
Task<List<MedicationPresentation>> medicationPresentationsTask = Task.FromResult(new List<MedicationPresentation>());
Task<List<GenericGroup>> genericGroupsTask = Task.FromResult(new List<GenericGroup>());
Task<List<HasSmrOpinion>> hasSmrOpinionsTask = Task.FromResult(new List<HasSmrOpinion>());
Task<List<HasAsmrOpinion>> hasAsmrOpinionsTask = Task.FromResult(new List<HasAsmrOpinion>());
Task<List<ImportantInformation>> importantInformationsTask = Task.FromResult(new List<ImportantInformation>());
Task<List<PrescriptionDispensingConditions>> prescriptionDispensingConditionsTask = Task.FromResult(new List<PrescriptionDispensingConditions>());
Task<List<TransparencyCommissionOpinionLinks>> transparencyCommissionOpinionLinksTask = Task.FromResult(new List<TransparencyCommissionOpinionLinks>());
Task<List<PharmaceuticalSpecialty>> pharmaceuticalSpecialtiesTask = Task.FromResult(new List<PharmaceuticalSpecialty>());
// Pour chaque jeu de données, on lance une tâche de téléchargement et de conversion.
foreach (var dataset in datasets)
{
switch (dataset)
{
case CIS_bdpm:
medicationsTask = DownloadAndConvertToCsvRecordsAsync<Medication>(CIS_bdpm);
tasks.Add(medicationsTask);
break;
case CIS_COMPO_bdpm:
medicationCompositionsTask = DownloadAndConvertToCsvRecordsAsync<MedicationComposition>(CIS_COMPO_bdpm);
tasks.Add(medicationCompositionsTask);
break;
case CIS_CIP_bdpm:
medicationPresentationsTask = DownloadAndConvertToCsvRecordsAsync<MedicationPresentation>(CIS_CIP_bdpm);
tasks.Add(medicationPresentationsTask);
break;
case CIS_GENER_bdpm:
genericGroupsTask = DownloadAndConvertToCsvRecordsAsync<GenericGroup>(CIS_GENER_bdpm);
tasks.Add(genericGroupsTask);
break;
case CIS_HAS_SMR_bdpm:
hasSmrOpinionsTask = DownloadAndConvertToCsvRecordsAsync<HasSmrOpinion>(CIS_HAS_SMR_bdpm);
tasks.Add(hasSmrOpinionsTask);
break;
case CIS_HAS_ASMR_bdpm:
hasAsmrOpinionsTask = DownloadAndConvertToCsvRecordsAsync<HasAsmrOpinion>(CIS_HAS_ASMR_bdpm);
tasks.Add(hasAsmrOpinionsTask);
break;
case CIS_InfoImportantes:
importantInformationsTask = DownloadAndConvertToCsvRecordsAsync<ImportantInformation>(CIS_InfoImportantes);
tasks.Add(importantInformationsTask);
break;
case CIS_CPD_bdpm:
prescriptionDispensingConditionsTask = DownloadAndConvertToCsvRecordsAsync<PrescriptionDispensingConditions>(CIS_CPD_bdpm);
tasks.Add(prescriptionDispensingConditionsTask);
break;
case HAS_LiensPageCT_bdpm:
transparencyCommissionOpinionLinksTask = DownloadAndConvertToCsvRecordsAsync<TransparencyCommissionOpinionLinks>(HAS_LiensPageCT_bdpm);
tasks.Add(transparencyCommissionOpinionLinksTask);
break;
case CIS_CIP_Dispo_Spec:
pharmaceuticalSpecialtiesTask = DownloadAndConvertToCsvRecordsAsync<PharmaceuticalSpecialty>(CIS_CIP_Dispo_Spec);
tasks.Add(pharmaceuticalSpecialtiesTask);
break;
default:
throw new Exception($"Jeu de données inconnu: {dataset}");
}
}
// On attend que toutes les tâches soient terminées.
await Task.WhenAll(tasks);
// On récupère les résultats des tâches.
medications = medicationsTask.Result;
medicationCompositions = medicationCompositionsTask.Result;
medicationPresentations = medicationPresentationsTask.Result;
genericGroups = genericGroupsTask.Result;
hasSmrOpinions = hasSmrOpinionsTask.Result;
hasAsmrOpinions = hasAsmrOpinionsTask.Result;
importantInformations = importantInformationsTask.Result;
prescriptionDispensingConditions = prescriptionDispensingConditionsTask.Result;
transparencyCommissionOpinionLinks = transparencyCommissionOpinionLinksTask.Result;
pharmaceuticalSpecialties = pharmaceuticalSpecialtiesTask.Result;
}
/// <summary>
/// Enregistre les jeux de données spécifiés dans le répertoire de sortie.
/// </summary>
/// <param name="datasets">Liste des jeux de données à enregistrer.</param>
/// <param name="output">Répertoire de sortie.</param>
public static async Task SaveDatasets(List<string> datasets, DirectoryInfo output)
{
// Initialisation de la liste des tâches.
List<Task> tasks = new List<Task>();
// Pour chaque jeu de données, on lance une tâche d'enregistrement.
foreach (var dataset in datasets)
{
switch (dataset)
{
case CIS_bdpm:
tasks.Add(SaveAsJsonAsync(medications, output, new FileInfo(CIS_bdpm)));
break;
case CIS_COMPO_bdpm:
tasks.Add(SaveAsJsonAsync(medicationCompositions, output, new FileInfo(CIS_COMPO_bdpm)));
break;
case CIS_CIP_bdpm:
tasks.Add(SaveAsJsonAsync(medicationPresentations, output, new FileInfo(CIS_CIP_bdpm)));
break;
case CIS_GENER_bdpm:
tasks.Add(SaveAsJsonAsync(genericGroups, output, new FileInfo(CIS_GENER_bdpm)));
break;
case CIS_HAS_SMR_bdpm:
tasks.Add(SaveAsJsonAsync(hasSmrOpinions, output, new FileInfo(CIS_HAS_SMR_bdpm)));
break;
case CIS_HAS_ASMR_bdpm:
tasks.Add(SaveAsJsonAsync(hasAsmrOpinions, output, new FileInfo(CIS_HAS_ASMR_bdpm)));
break;
case CIS_InfoImportantes:
tasks.Add(SaveAsJsonAsync(importantInformations, output, new FileInfo(CIS_InfoImportantes)));
break;
case CIS_CPD_bdpm:
tasks.Add(SaveAsJsonAsync(prescriptionDispensingConditions, output, new FileInfo(CIS_CPD_bdpm)));
break;
case HAS_LiensPageCT_bdpm:
tasks.Add(SaveAsJsonAsync(transparencyCommissionOpinionLinks, output, new FileInfo(HAS_LiensPageCT_bdpm)));
break;
case CIS_CIP_Dispo_Spec:
tasks.Add(SaveAsJsonAsync(pharmaceuticalSpecialties, output, new FileInfo(CIS_CIP_Dispo_Spec)));
break;
default:
throw new Exception($"Jeu de données inconnu: {dataset}");
}
}
// On attend que toutes les tâches soient terminées.
await Task.WhenAll(tasks);
}
/// <summary>
/// Télécharge les jeux de données spécifiés à l'URI de sortie.
/// </summary>
/// <param name="datasets">Liste des jeux de données à télécharger.</param>
/// <param name="output">URI de sortie.</param>
public static async Task UploadDatasets(List<string> datasets, Uri output)
{
// Initialisation de la liste des tâches.
List<Task> tasks = new List<Task>();
// Pour chaque jeu de données, on lance une tâche de téléchargement.
foreach (var dataset in datasets)
{
switch (dataset)
{
case CIS_bdpm:
tasks.Add(UploadJsonAsync(medications, output));
break;
case CIS_COMPO_bdpm:
tasks.Add(UploadJsonAsync(medicationCompositions, output));
break;
case CIS_CIP_bdpm:
tasks.Add(UploadJsonAsync(medicationPresentations, output));
break;
case CIS_GENER_bdpm:
tasks.Add(UploadJsonAsync(genericGroups, output));
break;
case CIS_HAS_SMR_bdpm:
tasks.Add(UploadJsonAsync(hasSmrOpinions, output));
break;
case CIS_HAS_ASMR_bdpm:
tasks.Add(UploadJsonAsync(hasAsmrOpinions, output));
break;
case CIS_InfoImportantes:
tasks.Add(UploadJsonAsync(importantInformations, output));
break;
case CIS_CPD_bdpm:
tasks.Add(UploadJsonAsync(prescriptionDispensingConditions, output));
break;
case HAS_LiensPageCT_bdpm:
tasks.Add(UploadJsonAsync(transparencyCommissionOpinionLinks, output));
break;
case CIS_CIP_Dispo_Spec:
tasks.Add(UploadJsonAsync(pharmaceuticalSpecialties, output));
break;
default:
throw new Exception($"Jeu de données inconnu: {dataset}");
}
}
// On attend que toutes les tâches soient terminées.
await Task.WhenAll(tasks);
}
/// <summary>
/// Fusionne les différentes listes de données en une seule liste de médicaments.
/// </summary>
public static void Merge()
{
// Fusion des avis SMR de la HAS avec les liens vers les avis de la Commission de la transparence.
hasSmrOpinions
.GroupJoin(
transparencyCommissionOpinionLinks,
hasSmrOpinion => hasSmrOpinion.HasDossierCode,
transparencyCommissionOpinionLink => transparencyCommissionOpinionLink.HasDossierCode,
(hasAsmrOpinion, transparencyCommissionOpinionLink) =>
{
hasAsmrOpinion.TransparencyCommissionOpinionLinks = transparencyCommissionOpinionLink.ToList();
return hasAsmrOpinion;
}
)
.ToList();
// Fusion des avis ASMR de la HAS avec les liens vers les avis de la Commission de la transparence.
hasAsmrOpinions
.GroupJoin(
transparencyCommissionOpinionLinks,
hasAsmrOpinion => hasAsmrOpinion.HasDossierCode,
transparencyCommissionOpinionLink => transparencyCommissionOpinionLink.HasDossierCode,
(hasAsmrOpinion, transparencyCommissionOpinionLink) =>
{
hasAsmrOpinion.TransparencyCommissionOpinionLinks = transparencyCommissionOpinionLink.ToList();
return hasAsmrOpinion;
}
)
.ToList();
// Fusion des différentes listes de données en une seule liste de médicaments.
medications
.GroupJoin(
medicationCompositions,
medication => medication.CISCode,
medicationComposition => medicationComposition.CISCode,
(medication, medicationComposition) =>
{
medication.MedicationCompositions = medicationComposition.ToList();
return medication;
}
)
.GroupJoin(
medicationPresentations,
medication => medication.CISCode,
medicationPresentation => medicationPresentation.CISCode,
(medication, medicationPresentation) =>
{
medication.MedicationPresentations = medicationPresentation.ToList();
return medication;
}
)
.GroupJoin(
genericGroups,
medication => medication.CISCode,
genericGroup => genericGroup.CISCode,
(medication, genericGroup) =>
{
medication.GenericGroups = genericGroup.ToList();
return medication;
}
)
.GroupJoin(
hasSmrOpinions,
medication => medication.CISCode,
hasSmrOpinion => hasSmrOpinion.CISCode,
(medication, hasSmrOpinion) =>
{
medication.HasSmrOpinions = hasSmrOpinion.ToList();
return medication;
}
)
.GroupJoin(
hasAsmrOpinions,
medication => medication.CISCode,
hasAsmrOpinion => hasAsmrOpinion.CISCode,
(medication, hasAsmrOpinion) =>
{
medication.HasAsmrOpinions = hasAsmrOpinion.ToList();
return medication;
}
)
.GroupJoin(
importantInformations,
medication => medication.CISCode,
importantInformation => importantInformation.CISCode,
(medication, importantInformation) =>
{
medication.ImportantInformations = importantInformation.ToList();
return medication;
}
)
.GroupJoin(
prescriptionDispensingConditions,
medication => medication.CISCode,
prescriptionDispensingCondition => prescriptionDispensingCondition.CISCode,
(medication, prescriptionDispensingCondition) =>
{
medication.PrescriptionDispensingConditions = prescriptionDispensingCondition.ToList();
return medication;
}
)
.GroupJoin(
pharmaceuticalSpecialties,
medication => medication.CISCode,
pharmaceuticalSpecialty => pharmaceuticalSpecialty.CISCode,
(medication, pharmaceuticalSpecialty) =>
{
medication.PharmaceuticalSpecialties = pharmaceuticalSpecialty.ToList();
return medication;
}
)
.ToList();
}
/// <summary>
/// Télécharge de manière asynchrone le fichier spécifié à partir de l'API de base de données publique des médicaments.
/// </summary>
/// <param name="fileName">Le nom du fichier à télécharger.</param>
/// <returns>Retourne le contenu du fichier sous forme de chaîne de caractères.</returns>
public static async Task<string> DownloadAsync(string fileName)
{
// Création d'un nouveau client HTTP.
using (HttpClient client = new HttpClient())
{
// Construction de l'URI de base de l'API.
Uri baseApiUri = new Uri("https://base-donnees-publique.medicaments.gouv.fr/telechargement.php?fichier=");
var fileUriBuilder = new UriBuilder(baseApiUri);
// Ajout du nom du fichier à l'URI.
fileUriBuilder.Query += fileName + ".txt";
Uri fileUri = fileUriBuilder.Uri;
// Envoi d'une requête GET à l'URI du fichier.
HttpResponseMessage response = await client.GetAsync(fileUri);
if (response.IsSuccessStatusCode)
{
// Si la réponse est un succès, on lit le contenu de la réponse.
if (response.Content.Headers.ContentType != null)
{
// On définit l'encodage du contenu sur "latin1".
response.Content.Headers.ContentType.CharSet = "latin1";
}
string result = await response.Content.ReadAsStringAsync();
return result;
}
else
{
// Si la réponse est un échec, on lance une exception avec le code d'état de la réponse.
throw new Exception($"Error: {response.StatusCode}");
}
}
}
/// <summary>
/// Convertit les données CSV en une liste d'enregistrements de type T.
/// </summary>
/// <param name="csvData">Les données CSV sous forme de chaîne de caractères.</param>
/// <returns>Retourne une liste d'enregistrements de type T.</returns>
public static List<T> ConvertToCsvRecords<T>(string csvData)
{
// Utilisation d'un lecteur de texte pour lire les données CSV.
using (TextReader reader = new StringReader(csvData))
{
// Configuration du lecteur CSV.
var csvConfig = new CsvConfiguration(CultureInfo.InvariantCulture)
{
Delimiter = "\t", // Définition du délimiteur sur la tabulation.
HasHeaderRecord = false, // Indication qu'il n'y a pas d'en-tête.
TrimOptions = TrimOptions.Trim, // Indication que les valeurs doivent être nettoyées.
IgnoreBlankLines = true, // Indication que les lignes vides doivent être ignorées.
BadDataFound = null, // Indication que les données incorrectes doivent être ignorées.
};
// Utilisation d'un lecteur CSV pour lire les données CSV.
using (var csv = new CsvReader(reader, csvConfig))
{
// Conversion des données CSV en une liste d'enregistrements de type T.
var records = csv.GetRecords<T>().ToList();
return records;
}
}
}
/// <summary>
/// Télécharge de manière asynchrone le fichier spécifié et le convertit en une liste d'enregistrements CSV de type T.
/// </summary>
/// <param name="fileName">Le nom du fichier à télécharger.</param>
/// <returns>Retourne une liste d'enregistrements CSV de type T.</returns>
public static async Task<List<T>> DownloadAndConvertToCsvRecordsAsync<T>(string fileName)
{
// Téléchargement des données CSV.
string csvData = await DownloadAsync(fileName);
// Conversion des données CSV en une liste d'enregistrements de type T.
List<T> records = ConvertToCsvRecords<T>(csvData);
return records;
}
/// <summary>
/// Enregistre une liste d'enregistrements de type T en format JSON dans un fichier spécifié.
/// </summary>
/// <param name="records">La liste d'enregistrements à enregistrer.</param>
/// <param name="output">Le répertoire de sortie où le fichier sera enregistré.</param>
/// <param name="fileName">Le nom du fichier de sortie.</param>
public static async Task SaveAsJsonAsync<T>(List<T> records, DirectoryInfo output, FileInfo fileName)
{
// Si le répertoire de sortie n'existe pas, on le crée.
if (!output.Exists)
{
output.Create();
}
// Si le répertoire de sortie existe et contient déjà un fichier avec le même nom, on le supprime.
else if (output.Exists && output.GetFiles().Any(f => f.Name == fileName.Name + ".json"))
{
output.GetFiles().Where(f => f.Name == fileName.Name + ".json").ToList().ForEach(f => f.Delete());
}
// Sérialisation des enregistrements en format JSON.
string json = JsonSerializer.Serialize(
records,
jsonSerializerOptions
);
// Écriture du JSON dans le fichier de sortie.
await File.WriteAllTextAsync(output.FullName + "/" + fileName.Name + ".json", json);
}
/// <summary>
/// Télécharge de manière asynchrone une liste d'enregistrements de type T au format JSON vers une URI spécifiée.
/// </summary>
/// <param name="records">La liste d'enregistrements à télécharger.</param>
/// <param name="output">L'URI de sortie où les données seront téléchargées.</param>
public static async Task UploadJsonAsync<T>(List<T> records, Uri output)
{
// Sérialisation des enregistrements en format JSON.
string json = JsonSerializer.Serialize(
records,
jsonSerializerOptions
);
// Création d'un contenu de type StringContent avec le JSON, l'encodage UTF8 et le type de média "application/json".
StringContent content = new StringContent(json, Encoding.UTF8, "application/json");
// Utilisation d'un client HTTP pour envoyer les données.
using (HttpClient client = new HttpClient())
{
// Envoi d'une requête POST à l'URI de sortie avec le contenu.
HttpResponseMessage response = await client.PostAsync(output, content);
// Si la réponse n'est pas un succès, on lance une exception avec le code d'état de la réponse.
if (!response.IsSuccessStatusCode)
{
throw new Exception($"Error: {response.StatusCode}");
}
}
}
/// <summary>
/// Crée un modèle d'IA en générant un certain nombre de phrases, en les tokenisant et en les retournant sous forme de liste de données de phrases.
/// </summary>
/// <param name="sentenceCount">Le nombre de phrases à générer.</param>
/// <param name="input">Le fichier d'entrée contenant les prescriptions.</param>
public static List<SentenceData> MakeIAModel(int sentenceCount, FileInfo input)
{
Prescriptions prescriptions = new Prescriptions();
prescriptions.Prescription = File.ReadAllLines(input.FullName).ToList();
// Création d'une liste pour stocker les données des phrases.
List<SentenceData> sentences = new List<SentenceData>();
// Génération du nombre spécifié de phrases.
for (int i = 0; i < sentenceCount; i++)
{
// Obtention d'une prescription aléatoire.
string[] prescription = prescriptions.GetPrescription();
// Tokenisation de la prescription.
List<string> prescriptionToken = tokenize(prescription, Labels.O, Labels.O);
// Tant que la prescription contient le modèle de médicament,
// on le remplace par un nom de médicament aléatoire.
while (prescription.Contains(PatternPrescriptions.Drug))
{
// Création d'un objet Random pour générer un index aléatoire.
Random random = new Random();
// Génération d'un index aléatoire.
int index = random.Next(medications.Count);
// Obtention du médicament à l'index aléatoire.
Medication medication = medications[index];
// Division du nom du médicament en plusieurs mots.
string[] medicationName = medication.Name.Split(' ');
// Obtention de la position du modèle de médicament dans la prescription.
int medicationPosition = Array.IndexOf(prescription, PatternPrescriptions.Drug);
// Division de la prescription en deux parties : avant et après le modèle de médicament.
var tmp_left_prescription = prescription.Take(medicationPosition).ToList();
var tmp_right_prescription = prescription.Skip(medicationPosition + 1).ToList();
// Remplacement du modèle de médicament par le nom du médicament dans la prescription.
prescription = tmp_left_prescription.Concat(medicationName).Concat(tmp_right_prescription).ToArray();
// Division des tokens de la prescription en deux parties : avant et après le modèle de médicament.
var tmp_left_prescriptionToken = prescriptionToken.Take(medicationPosition).ToList();
var tmp_right_prescriptionToken = prescriptionToken.Skip(medicationPosition + 1).ToList();
// Remplacement du modèle de médicament par les tokens du nom du médicament dans les tokens de la prescription.
prescriptionToken = tmp_left_prescriptionToken.Concat(tokenize(medicationName, Labels.B_Drug, Labels.I_Drug)).Concat(tmp_right_prescriptionToken).ToList();
}
// Tant que la prescription contient le modèle de quantité de médicament,
// on le remplace par une quantité aléatoire.
while (prescription.Contains(PatternPrescriptions.DrugQuantity))
{
// Création d'un objet Random pour générer une quantité aléatoire.
Random random = new Random();
// Génération d'une quantité aléatoire entre 1 et 10.
int quantity = random.Next(1, 10);
// Conversion de la quantité en tableau de chaînes de caractères.
string[] medicationQuantity = new string[] { quantity.ToString() };
// Obtention de la position du modèle de quantité de médicament dans la prescription.
int quantityPosition = Array.IndexOf(prescription, PatternPrescriptions.DrugQuantity);
// Division de la prescription en deux parties : avant et après le modèle de quantité de médicament.
var tmp_left_prescription = prescription.Take(quantityPosition).ToList();
var tmp_right_prescription = prescription.Skip(quantityPosition + 1).ToList();
// Remplacement du modèle de quantité de médicament par la quantité dans la prescription.
prescription = tmp_left_prescription.Concat(medicationQuantity).Concat(tmp_right_prescription).ToArray();
// Division des tokens de la prescription en deux parties : avant et après le modèle de quantité de médicament.
var tmp_left_prescriptionToken = prescriptionToken.Take(quantityPosition).ToList();
var tmp_right_prescriptionToken = prescriptionToken.Skip(quantityPosition + 1).ToList();
// Remplacement du modèle de quantité de médicament par les tokens de la quantité dans les tokens de la prescription.
prescriptionToken = tmp_left_prescriptionToken.Concat(tokenize(medicationQuantity, Labels.B_DrugQuantity, Labels.I_DrugQuantity)).Concat(tmp_right_prescriptionToken).ToList();
}
// Tant que la prescription contient le modèle de fréquence de médicament,
// on le remplace par une fréquence aléatoire.
while (prescription.Contains(PatternPrescriptions.DrugFrequency))
{
// Création d'un objet Random pour générer un index aléatoire.
Random random = new Random();
// Génération d'un index aléatoire.
int index = random.Next(PatternPrescriptionsData.Frequency.Count);
// Obtention de la fréquence à l'index aléatoire.
string[] medicationFrequency = PatternPrescriptionsData.Frequency[index].Split(' ');
// Obtention de la position du modèle de fréquence de médicament dans la prescription.
int frequencyPosition = Array.IndexOf(prescription, PatternPrescriptions.DrugFrequency);
// Division de la prescription en deux parties : avant et après le modèle de fréquence de médicament.
var tmp_left_prescription = prescription.Take(frequencyPosition).ToList();
var tmp_right_prescription = prescription.Skip(frequencyPosition + 1).ToList();
// Remplacement du modèle de fréquence de médicament par la fréquence dans la prescription.
prescription = tmp_left_prescription.Concat(medicationFrequency).Concat(tmp_right_prescription).ToArray();
// Division des tokens de la prescription en deux parties : avant et après le modèle de fréquence de médicament.
var tmp_left_prescriptionToken = prescriptionToken.Take(frequencyPosition).ToList();
var tmp_right_prescriptionToken = prescriptionToken.Skip(frequencyPosition + 1).ToList();
// Remplacement du modèle de fréquence de médicament par les tokens de la fréquence dans les tokens de la prescription.
prescriptionToken = tmp_left_prescriptionToken.Concat(tokenize(medicationFrequency, Labels.B_DrugFrequency, Labels.I_DrugFrequency)).Concat(tmp_right_prescriptionToken).ToList();
}
// Tant que la prescription contient le modèle de durée de médicament,
// on le remplace par une durée aléatoire.
while (prescription.Contains(PatternPrescriptions.DrugDuration))
{
// Création d'un objet Random pour générer un index et un nombre aléatoires.
Random random = new Random();
// Génération d'un index aléatoire.
int index = random.Next(PatternPrescriptionsData.Duration.Count);
// Génération d'un nombre aléatoire entre 1 et 10.
int number = random.Next(1, 10);
// Création de la durée du médicament en combinant le nombre et la durée à l'index aléatoire.
string[] medicationDuration = $"{number} {PatternPrescriptionsData.Duration[index]}".Split(' ');
// Obtention de la position du modèle de durée de médicament dans la prescription.
int durationPosition = Array.IndexOf(prescription, PatternPrescriptions.DrugDuration);
// Division de la prescription en deux parties : avant et après le modèle de durée de médicament.
var tmp_left_prescription = prescription.Take(durationPosition).ToList();
var tmp_right_prescription = prescription.Skip(durationPosition + 1).ToList();
// Remplacement du modèle de durée de médicament par la durée dans la prescription.
prescription = tmp_left_prescription.Concat(medicationDuration).Concat(tmp_right_prescription).ToArray();
// Division des tokens de la prescription en deux parties : avant et après le modèle de durée de médicament.
var tmp_left_prescriptionToken = prescriptionToken.Take(durationPosition).ToList();
var tmp_right_prescriptionToken = prescriptionToken.Skip(durationPosition + 1).ToList();
// Remplacement du modèle de durée de médicament par les tokens de la durée dans les tokens de la prescription.
prescriptionToken = tmp_left_prescriptionToken.Concat(tokenize(medicationDuration, Labels.B_DrugDuration, Labels.I_DrugDuration)).Concat(tmp_right_prescriptionToken).ToList();
}
// Tant que la prescription contient le modèle de forme de médicament,
// on le remplace par une forme aléatoire.
while (prescription.Contains(PatternPrescriptions.DrugForm))
{
// Création d'un objet Random pour générer un index aléatoire.
Random random = new Random();
// Génération d'un index aléatoire.
int index = random.Next(PatternPrescriptionsData.Form.Count);
// Obtention de la forme à l'index aléatoire.
string[] medicationForm = PatternPrescriptionsData.Form[index].Split(' ');