diff --git a/docs/From10X/scRNA-seq/README.md b/docs/From10X/scRNA-seq/README.md index c1afb747..06cb8338 100644 --- a/docs/From10X/scRNA-seq/README.md +++ b/docs/From10X/scRNA-seq/README.md @@ -58,7 +58,7 @@ 让我们回到BioOS平台，来到我们的cellrangerTest页面。试试看，找到页面上的"运行参数"选项卡>输入参数>"上传JSON文件"，将您的json文件上传。 然后，点击页面上的绿色按钮"开始分析"，等待任务完成。 -![image](Pics/scRNA-seq_fig.1.png) +![image](WDL_Tools/Pics/scRNA-seq_fig.1.png) ## 查看结果 任务完成后，您可以在分析历史中看到您的任务。点击任务名称，进入任务详情页面。在任务详情页面，您可以查看/下载结果。 @@ -72,3 +72,39 @@ Bravo! 到此为止，您已经掌握了BioOS的基本使用方法，并成功完成了10X Genomics scRNA-seq的分析。但请注意，这只是冰山一角，BioOS还有更多的强大功能等待您的探索。下面，让我们结合一个更复杂的例子，来展示BioOS的强大之处。 + + + + + + + + 

+{
+  "cellranger_count_workflow.chemistry": "auto",
+  "cellranger_count_workflow.cpu": 32,
+  "cellranger_count_workflow.disk_space": "300 GB",
+  "cellranger_count_workflow.fastq_file_paths": [
+    "\"s3://bioos-wcnjupodeig44rr6t02v0/Example_10X_data/ERR8048237/5891STDY8062334_S1_L001_I1_001.fastq.gz\"",
+    "s3://bioos-wcnjupodeig44rr6t02v0/Example_10X_data/ERR8048237/5891STDY8062334_S1_L001_R1_001.fastq.gz",
+    "s3://bioos-wcnjupodeig44rr6t02v0/Example_10X_data/ERR8048237/5891STDY8062334_S1_L001_R2_001.fastq.gz"
+  ],
+  "cellranger_count_workflow.memory": "225 GB",
+  "cellranger_count_workflow.no_bam": "False",
+  "cellranger_count_workflow.reference_genome_tar_gz": "s3://bioos-wcnjupodeig44rr6t02v0/Example_10X_data/RAW/refdata-cellranger-GRCh38-3.0.0.tar.gz",
+  "cellranger_count_workflow.run_id": "\"ERR8048237\"",
+  "cellranger_count_workflow.sample": "\"5891STDY8062334\"",
+  "cellranger_count_workflow.secondary": "False"
+}
+
+ + + +