Skip to content

Commit

Permalink
Update tests
Browse files Browse the repository at this point in the history
  • Loading branch information
Louis Le Nezet committed Oct 7, 2024
1 parent 9d07901 commit 1048cf3
Show file tree
Hide file tree
Showing 6 changed files with 478 additions and 449 deletions.
198 changes: 99 additions & 99 deletions tests/testthat/_snaps/ped_to_legdf.md
View file
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -4,104 +4,104 @@
lst
Output
$df
id x0 y0 x1 y1 type fill border angle
1 titles 0.2000000 0 NA NA text black <NA> NA
2 titles 4.4770595 0 NA NA text black <NA> NA
3 titles 9.2009283 0 NA NA text black <NA> NA
4 titles 14.9391751 0 NA NA text black <NA> NA
5 titles 20.6170422 0 NA NA text black <NA> NA
6 sex 0.0000000 2 NA NA square_1_1 white black NA
7 sex 0.0000000 4 NA NA circle_1_1 white black NA
8 sex_label 1.2000000 2 NA NA text black <NA> NA
9 sex_label 1.2000000 4 NA NA text black <NA> NA
10 border 4.2770595 2 NA NA square_1_1 white black NA
11 border 4.2770595 4 NA NA square_1_1 white green NA
12 border_label 5.4770595 2 NA NA text black <NA> NA
13 border_label 5.4770595 4 NA NA text black <NA> NA
14 aff_bkg_1_0 9.0009283 2 NA NA square_1_1 white black NA
15 aff_bkg_1_1 9.0009283 4 NA NA square_1_1 white black NA
16 aff_bkg_1_NA 9.0009283 6 NA NA square_1_1 white black NA
17 affected_1_0 9.0009283 2 NA NA square_3_1 white black NA
18 affected_1_1 9.0009283 4 NA NA square_3_1 red black NA
19 affected_1_NA 9.0009283 6 NA NA square_3_1 grey black NA
20 affected_label_1_0 10.2009283 2 NA NA text black <NA> NA
21 affected_label_1_1 10.2009283 4 NA NA text black <NA> NA
22 affected_label_1_NA 10.2009283 6 NA NA text black <NA> NA
23 aff_bkg_2_0 14.7391751 2 NA NA square_1_1 white black NA
24 aff_bkg_2_1 14.7391751 4 NA NA square_1_1 white black NA
25 affected_2_0 14.7391751 2 NA NA square_3_2 white black NA
26 affected_2_1 14.7391751 4 NA NA square_3_2 red black NA
27 affected_label_2_0 15.9391751 2 NA NA text black <NA> NA
28 affected_label_2_1 15.9391751 4 NA NA text black <NA> NA
29 aff_bkg_3_1 20.4170422 2 NA NA square_1_1 white black NA
30 aff_bkg_3_2 20.4170422 4 NA NA square_1_1 white black NA
31 aff_bkg_3_3 20.4170422 6 NA NA square_1_1 white black NA
32 aff_bkg_3_4 20.4170422 8 NA NA square_1_1 white black NA
33 aff_bkg_3_5 20.4170422 10 NA NA square_1_1 white black NA
34 aff_bkg_3_6 20.4170422 12 NA NA square_1_1 white black NA
35 affected_3_1 20.4170422 2 NA NA square_3_3 #FFFFFF black NA
36 affected_3_2 20.4170422 4 NA NA square_3_3 #9AB1C4 black NA
37 affected_3_3 20.4170422 6 NA NA square_3_3 #36648B black NA
38 affected_3_4 20.4170422 8 NA NA square_3_3 #FFC0CB black NA
39 affected_3_5 20.4170422 10 NA NA square_3_3 #CF70DD black NA
40 affected_3_6 20.4170422 12 NA NA square_3_3 #A020F0 black NA
41 affected_label_3_1 21.6170422 2 NA NA text black <NA> NA
42 affected_label_3_2 21.6170422 4 NA NA text black <NA> NA
43 affected_label_3_3 21.6170422 6 NA NA text black <NA> NA
44 affected_label_3_4 21.6170422 8 NA NA text black <NA> NA
45 affected_label_3_5 21.6170422 10 NA NA text black <NA> NA
46 affected_label_3_6 21.6170422 12 NA NA text black <NA> NA
47 max_lim 0.0000000 0 NA NA text <NA> black NA
48 max_lim 27.6912336 12 NA NA text <NA> black NA
density cex label tips adjx adjy
1 NA 1.2 Sex <NA> 0 1
2 NA 1.2 Border <NA> 0 1
3 NA 1.2 affection <NA> 0 1
4 NA 1.2 avail <NA> 0 1
5 NA 1.2 val_num <NA> 0 1
6 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
7 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
8 NA 0.8 Male <NA> 0 1
9 NA 0.8 Female <NA> 0 1
10 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
11 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
12 NA 0.8 Non Available <NA> 0 1
13 NA 0.8 Available <NA> 0 1
14 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
15 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
16 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
17 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
18 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
19 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
20 NA 0.8 Healthy <= to 0.5 <NA> 0 1
21 NA 0.8 Affected > to 0.5 <NA> 0 1
22 NA 0.8 NA <NA> 0 1
23 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
24 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
25 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
26 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
27 NA 0.8 Healthy are FALSE <NA> 0 1
28 NA 0.8 Affected are TRUE <NA> 0 1
29 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
30 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
31 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
32 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
33 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
34 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
35 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
36 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
37 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
38 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
39 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
40 NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
41 NA 0.8 Healthy <= to 115 : [101,106] <NA> 0 1
42 NA 0.8 Healthy <= to 115 : (106,110] <NA> 0 1
43 NA 0.8 Healthy <= to 115 : (110,115] <NA> 0 1
44 NA 0.8 Affected > to 115 : [116,124] <NA> 0 1
45 NA 0.8 Affected > to 115 : (124,133] <NA> 0 1
46 NA 0.8 Affected > to 115 : (133,141] <NA> 0 1
47 NA NA <NA> <NA> 0 1
48 NA NA <NA> <NA> 0 1
id x0 y0 x1 y1 type fill border
1 titles 0.0000000 0.00000000 NA NA text black <NA>
2 titles 2.0692353 0.00000000 NA NA text black <NA>
3 titles 4.1533643 0.00000000 NA NA text black <NA>
4 titles 6.2713058 0.00000000 NA NA text black <NA>
5 titles 8.3872347 0.00000000 NA NA text black <NA>
6 sex 0.0000000 0.83333333 NA NA square_1_1 white black
7 sex 0.0000000 2.16666667 NA NA circle_1_1 white black
8 sex_label 1.0000000 1.33333333 NA NA text black <NA>
9 sex_label 1.0000000 2.66666667 NA NA text black <NA>
10 border 2.0692353 0.83333333 NA NA square_1_1 white black
11 border 2.0692353 2.16666667 NA NA square_1_1 white green
12 border_label 3.0692353 1.33333333 NA NA text black <NA>
13 border_label 3.0692353 2.66666667 NA NA text black <NA>
14 aff_bkg_1_0 4.1533643 0.83333333 NA NA square_1_1 white black
15 aff_bkg_1_1 4.1533643 2.16666667 NA NA square_1_1 white black
16 aff_bkg_1_NA 4.1533643 3.50000000 NA NA square_1_1 white black
17 affected_1_0 4.1533643 0.83333333 NA NA square_3_1 white black
18 affected_1_1 4.1533643 2.16666667 NA NA square_3_1 red black
19 affected_1_NA 4.1533643 3.50000000 NA NA square_3_1 grey black
20 affected_label_1_0 5.1533643 1.33333333 NA NA text black <NA>
21 affected_label_1_1 5.1533643 2.66666667 NA NA text black <NA>
22 affected_label_1_NA 5.1533643 4.00000000 NA NA text black <NA>
23 aff_bkg_2_0 6.2713058 0.83333333 NA NA square_1_1 white black
24 aff_bkg_2_1 6.2713058 2.16666667 NA NA square_1_1 white black
25 affected_2_0 6.2713058 0.83333333 NA NA square_3_2 white black
26 affected_2_1 6.2713058 2.16666667 NA NA square_3_2 red black
27 affected_label_2_0 7.2713058 1.33333333 NA NA text black <NA>
28 affected_label_2_1 7.2713058 2.66666667 NA NA text black <NA>
29 aff_bkg_3_1 8.3872347 0.83333333 NA NA square_1_1 white black
30 aff_bkg_3_2 8.3872347 2.16666667 NA NA square_1_1 white black
31 aff_bkg_3_3 8.3872347 3.50000000 NA NA square_1_1 white black
32 aff_bkg_3_4 8.3872347 4.83333333 NA NA square_1_1 white black
33 aff_bkg_3_5 8.3872347 6.16666667 NA NA square_1_1 white black
34 aff_bkg_3_6 8.3872347 7.50000000 NA NA square_1_1 white black
35 affected_3_1 8.3872347 0.83333333 NA NA square_3_3 #FFFFFF black
36 affected_3_2 8.3872347 2.16666667 NA NA square_3_3 #9AB1C4 black
37 affected_3_3 8.3872347 3.50000000 NA NA square_3_3 #36648B black
38 affected_3_4 8.3872347 4.83333333 NA NA square_3_3 #FFC0CB black
39 affected_3_5 8.3872347 6.16666667 NA NA square_3_3 #CF70DD black
40 affected_3_6 8.3872347 7.50000000 NA NA square_3_3 #A020F0 black
41 affected_label_3_1 9.3872347 1.33333333 NA NA text black <NA>
42 affected_label_3_2 9.3872347 2.66666667 NA NA text black <NA>
43 affected_label_3_3 9.3872347 4.00000000 NA NA text black <NA>
44 affected_label_3_4 9.3872347 5.33333333 NA NA text black <NA>
45 affected_label_3_5 9.3872347 6.66666667 NA NA text black <NA>
46 affected_label_3_6 9.3872347 8.00000000 NA NA text black <NA>
47 max_lim 0.0000000 0.00000000 NA NA text <NA> black
48 max_lim 8.3872347 8.00000000 NA NA text <NA> black
angle density cex label tips adjx adjy
1 NA NA 1.2 Sex <NA> 0 1
2 NA NA 1.2 Border <NA> 0 1
3 NA NA 1.2 affection <NA> 0 1
4 NA NA 1.2 avail <NA> 0 1
5 NA NA 1.2 val_num <NA> 0 1
6 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
7 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
8 NA NA 0.8 Male <NA> 0 1
9 NA NA 0.8 Female <NA> 0 1
10 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
11 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
12 NA NA 0.8 Non Available <NA> 0 1
13 NA NA 0.8 Available <NA> 0 1
14 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
15 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
16 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
17 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
18 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
19 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
20 NA NA 0.8 Healthy <= to 0.5 <NA> 0 1
21 NA NA 0.8 Affected > to 0.5 <NA> 0 1
22 NA NA 0.8 NA <NA> 0 1
23 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
24 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
25 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
26 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
27 NA NA 0.8 Healthy are FALSE <NA> 0 1
28 NA NA 0.8 Affected are TRUE <NA> 0 1
29 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
30 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
31 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
32 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
33 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
34 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
35 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
36 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
37 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
38 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
39 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
40 NA NA 0.5 <NA> <NA> NA NA
41 NA NA 0.8 Healthy <= to 115 : [101,106] <NA> 0 1
42 NA NA 0.8 Healthy <= to 115 : (106,110] <NA> 0 1
43 NA NA 0.8 Healthy <= to 115 : (110,115] <NA> 0 1
44 NA NA 0.8 Affected > to 115 : [116,124] <NA> 0 1
45 NA NA 0.8 Affected > to 115 : (124,133] <NA> 0 1
46 NA NA 0.8 Affected > to 115 : (133,141] <NA> 0 1
47 NA NA NA <NA> <NA> 0 1
48 NA NA NA <NA> <NA> 0 1
$par_usr
$par_usr$boxh
Expand All @@ -114,7 +114,7 @@
[1] 0.8
$par_usr$usr
[1] 0.000000 27.691234 0.000000 12.000000
[1] 0.0000000 9.3872347 0.0000000 8.0000000

Loading

0 comments on commit 1048cf3

Please sign in to comment.