Script codado em python que utiliza processamento de imagem para analisar imagens de géis de corrida de proteínas (SDS-Page) e quantificar, por meio da intensidade da luz, a quantidade de proteínas em cada colunas do gel.
programadores: andre.araujocaetano.profissional@gmail.com / beatrizborgesribeiro2@gmail.com
No geral, apesar de as funções serem grandes, o pipeline do script é bem simples.
- Rode as bibliotecas de funções
- Você terá duas opções de exemplos, mostrando o processo (que é indicado caso não esteja familiarizado) e sem mostrar o processo.
- Substituia o nome da variável
imagem_original
pela imagem que você quer analisar, a linhaimagem_rgb
é utilizada para transformar em 3 dimensões caso sua imagem de RGB esteja em 4 dimensões. - Utilize a função
processamento_imagem
para colocar a imagem em tons de cinza, o que torna mais fácil o processamento. - Set as variáveis
x
ey
para recotar as colunas que deseja com a funçãorecortar_imagem
, lembrando que essa função recebe, além da imagem, uma lista para o eixo x e uma lista para o eixo y sendo: o primeiro valor o ponto da esquerda e o segundo o ponto da direita e o recorte ocorrerá nesse range. - Por fim, coloque todos os recortes dentro de uma lista e utilize a função
plotar_resultados
para comparar a intensidade de proteína em uma oun
colunas que queira analisar. - Qualquer dúvida entre em contato.
“Eu quero ser forte o suficiente para que ninguém se preocupe comigo. Para sempre vencer… Para sempre salvar a todos. Eu quero ser… o maior herói.” - Izuku, Midoriya.