Skip to content

Commit

Permalink
update faq (#4543)
Browse files Browse the repository at this point in the history
* update faq for uploading new data

* fix add data faq

* additional faq
  • Loading branch information
jklugherz authored Jan 17, 2025
1 parent 5f2a8b8 commit 1b2e036
Showing 1 changed file with 72 additions and 9 deletions.
81 changes: 72 additions & 9 deletions ui/pages/Public/components/Faq.jsx
Original file line number Diff line number Diff line change
Expand Up @@ -80,7 +80,7 @@ const FAQS = [
),
},
[SPANISH]: {
header: 'P. ¿Qué análisis no admite seqr?',
header: 'P. ¿Qué tipos de análisis no admite seqr?',
content: (
<List bulleted>
<List.Item>
Expand All @@ -89,7 +89,7 @@ const FAQS = [
esperar ver.
</List.Item>
<List.Item>
seqr no es un annotation pipeline para un VCF. Aunque las anotaciones se agregan cuando los datos se cargan
seqr no es un canal de anotación para un VCF. Aunque las anotaciones se agregan cuando los datos se cargan
en seqr, no se puede generar el VCF anotado de seqr.
</List.Item>
<List.Item>
Expand Down Expand Up @@ -369,7 +369,7 @@ const FAQS = [
),
},
[SPANISH]: {
header: '¿Cómo agrego un nuevo miembro del equipo a un proyecto?',
header: 'P. ¿Cómo agrego un nuevo miembro del equipo a un proyecto?',
content: (
<div>
Para agregar un nuevo colaborador, navegue al espacio de trabajo respectivo en AnVIL y seleccione
Expand Down Expand Up @@ -466,15 +466,16 @@ const FAQS = [
}, {
[ENGLISH]: {
header: 'Q. How do I add data to an existing project in seqr?',
content: `To add new data, create a new joint called VCF with all the samples you want in your seqr project,
including those you had previously loaded, and upload it using the Load Additional Data feature on the Project
Page. All notes and tags saved in previously analyzed cases will be kept.`,
content: `To add new data, create a new joint called VCF with all the samples you want to include in your update.
This should include any new samples you want to add to the project and any of their family members which have been previously loaded.
Load this VCF using the Load Additional Data feature on the Project Page. All notes and tags saved in previously analyzed cases will be kept.`,
},
[SPANISH]: {
header: 'P. ¿Cómo puedo agregar datos a un proyecto existente en seqr?',
content: `Para agregar nuevos datos, cree un nuevo conjunto denominado VCF con todas las muestras que desee en su
proyecto seqr, incluyendo las que había cargado previamente, y cárgala usando la función “Load Additional Data” en
la página “Project Page”. Se conservarán todas las notas y etiquetas guardadas en casos previamente analizados.`,
content: `Para agregar nuevos datos, crea un nuevo conjunto denominado VCF con todas las muestras que desea incluir en su actualización.
Esto debe incluir todas las muestras nuevas que desea agregar al proyecto y todos los miembros de la familia que se hayan cargado previamente.
Cargue este VCF utilizando la función Cargar datos adicionales en la página del proyecto.
Se conservarán todas las notas y etiquetas guardadas en los casos analizados previamente.`,
},
}, {
[ENGLISH]: {
Expand Down Expand Up @@ -506,6 +507,68 @@ const FAQS = [
</div>
),
},
}, {
[ENGLISH]: {
header: 'Q. Who has access to my data in seqr?',
content: (
<div>
A seqr project is accessible only to the person who requested the data loading and any additional members
they add to the project through the AnVIL workspace. Members of the Broad Institute cannot access the project,
except for a small number of engineers and the product owner on the seqr team,
who may review the data if necessary. <br /><br />

Non-identifiable information such as an individual’s affected status, high-level phenotype information,
variant quality scores, and aggregate allele counts can be accessed by all seqr users through the
Variant Lookup to aid in analysis.
</div>
),
},
[SPANISH]: {
header: 'P. ¿Quién tiene acceso a mis datos en seqr?',
content: (
<div>
Un proyecto de seqr es accesible sólo a la persona que solicitó la carga de datos y cualquier miembro
adicional que agregue al proyecto a través del espacio de trabajo AnVIL. Los miembros del Broad Institute
no pueden acceder al proyecto, excepto una pequeña cantidad de ingenieros y el propietario del producto en el
equipo seqr, quienes pueden revisar los datos si es necesario.<br /><br />

Todos los usuarios de seqr pueden acceder a información no identificable, como el estado de afección de un
individuo, información de fenotipo de alto nivel, puntajes de calidad de variantes y recuentos de alelos
agregados, a través de la Búsqueda de variantes para ayudar en el análisis.
</div>
),
},
}, {
[ENGLISH]: {
header: 'Q. How can I delete a project in seqr?',
content: (
<div>
Before data has been loaded to a search project, the person who created the project can delete it from the
seqr home page by selecting the hamburger menu on the right side of the project and selecting the delete
project option. Once data has been loaded to a project, it can not be deleted. If you later learn that a
sample does not have the appropriate permissions to be in seqr, you can reach out to us
explaining the situation. <br /><br />

Please note that deleting an AnVIL workspace does not remove its corresponding project from seqr;
however, it will make it impossible for your team to access or manage the project in the future.
</div>
),
},
[SPANISH]: {
header: 'P. ¿Cómo puedo eliminar un proyecto de seqr?',
content: (
<div>
Antes de que se hayan cargado los datos en un proyecto de búsqueda, la persona que creó el proyecto puede
eliminarlo desde la página de inicio seleccionando el menú al lado derecho del proyecto y seleccionando la
opción de eliminar proyecto. Una vez que se han cargado los datos en un proyecto, no se pueden eliminar.
Si más adelante descubre que una muestra no tiene los permisos adecuados para estar en seqr,
puede comunicarse con nosotros para explicar la situación.<br /><br />

Tenga en cuenta que eliminando un espacio de trabajo de AnVIL no elimina su proyecto correspondiente de seqr;
sin embargo, hará que sea imposible para su equipo acceder o administrar el proyecto en el futuro.
</div>
),
},
}, {
[ENGLISH]: {
header: 'Q. Have ideas for seqr?',
Expand Down

0 comments on commit 1b2e036

Please sign in to comment.