Using baysian-optimazation for cell free
├── .vscode
├── analysis <- データ分析用のコード
├── bayesian_optimization <- 次の実験候補を選択するために使われるコード。初回候補をD最適基準で選ぶためのコードもここにある
├── build_samples <- 実験候補を作成するためのコード
├── data
│ ├── acuisiton_function_prediction <- 獲得関数の計算結果
│ ├── estimated_y_prediction_gpr_one_kernel <- 発現量の予測値
│ ├── estimated_y_prediction_gpr_one_kernel_std <- 発現量の予測値の標準偏差
│ ├── old_data <- 最初の頃使用していたが失敗したため使っていないデータ
│ ├── remaining_samples <- 実験ごとに未使用の実験候補を保存する
│ ├── result <- 毎回の実験結果を保存する
│ ├── next_samples <- 選択された次の実験候補
│ ├── generated_samples.csv <- build_samplesで作成された実験候補
│ └── result.csv <- 全ラウンドの実験結果を一つのファイルにまとめたもの
│
├── env
├── .env
├── .gitignore
├── LICENSE
├── Makefile
├── README.md
├── requirements.txt
├── setup.py
├── test_environment.py
└── tox.ini
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