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OOAAHH authored Oct 28, 2024
1 parent 441afb9 commit 39f8d8a
Showing 1 changed file with 16 additions and 10 deletions.
26 changes: 16 additions & 10 deletions docs/From10X/scRNA-seq/README.md
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Expand Up @@ -59,27 +59,33 @@

然后,点击页面上的绿色按钮"开始分析",等待任务完成。
<p align="center">
<img src="../../Pics/scRNA-seq_fig.1.png" alt="注意右上角的绿色按钮,点击这里即可开始分析,并在3s后自动跳转到分析历史界面" style="width:50%; height:auto;"/>
<img src="../../Pics/scRNA-seq_fig.1.png" alt="注意右上角的绿色按钮,点击这里即可开始分析,并在3s后自动跳转到分析历史界面" title="这还是测试" style="width80%; height:auto;"/>
</p>

<p align="center">
<img src="/docs/Pics/scRNA-seq_fig.1.png" alt="注意右上角的绿色按钮,点击这里即可开始分析,并在3s后自动跳转到分析历史界面" style="width:50%; height:auto;"/>
<img src="../../Pics/scRNA-seq_fig.1.png" alt="注意右上角的绿色按钮,点击这里即可开始分析,并在3s后自动跳转到分析历史界面" style="width:auto; height:auto;"/>
</p>

<p align="center">
<img src="https://github.com/rnacentre/WDL_Tools/blob/gh-pages/WDL_Tools/docs/Pics/scRNA-seq_fig.1.png" alt="注意右上角的绿色按钮,点击这里即可开始分析,并在3s后自动跳转到分析历史界面" style="width:50%; height:auto;"/>
</p>



## 查看结果
任务完成后,您可以在分析历史中看到您的任务。点击任务名称,进入任务详情页面。在任务详情页面,您可以查看/下载结果。
![image](Pics/scRNA-seq_fig.2.png)
<p align="center">
<img src="../../Pics/scRNA-seq_fig.2.png" alt="现在这张图片展示了任务分析历史的详情,你可以在这里再次查阅输入和输出参数。当然你也可以在这里查看或下载结果" style="width:80%; height:auto;"/>
</p>
点击"查看",让我们来看看结果吧!所有的结果文件都会列出在这里,除了结果之外,也包括运行日志等文件,这取决于WDL文件的具体设置。
![image](Pics/scRNA-seq_fig.3.png)
<p align="center">
<img src="../../Pics/scRNA-seq_fig.3.png" alt="注意右上角的绿色按钮,点击这里即可开始分析,并在3s后自动跳转到分析历史界面" style="width:80%; height:auto;"/>
</p>
在这个示例中,我们需要的文件在"outs"文件夹中,让我们逐渐深入文件夹,找到我们需要的文件。
![image](Pics/scRNA-seq_fig.4.png)
<p align="center">
<img src="../../Pics/scRNA-seq_fig.4.png" alt="注意右上角的绿色按钮,点击这里即可开始分析,并在3s后自动跳转到分析历史界面" style="width:80%; height:auto;"/>
</p>
比如,我们希望直接拿到filtered_feature_bc_matrix.h5ad文件,点击"下载",我们可以下载结果。
![image](Pics/scRNA-seq_fig.5.png)
<p align="center">
<img src="../../Pics/scRNA-seq_fig.5.png" alt="注意右上角的绿色按钮,点击这里即可开始分析,并在3s后自动跳转到分析历史界面" style="width:80%; height:auto;"/>
</p>

Bravo! 到此为止,您已经掌握了BioOS的基本使用方法,并成功完成了10X Genomics scRNA-seq的分析。但请注意,这只是冰山一角,BioOS还有更多的强大功能等待您的探索。下面,让我们结合一个更复杂的例子,来展示BioOS的强大之处。
Bravo! 到此为止,您已经掌握了BioOS的基本使用方法,并成功完成了一次10X Genomics scRNA-seq的分析。但请注意,这只是冰山一角,BioOS还有更多的强大功能等待您的探索。下面,让我们结合一个更复杂的例子,来展示BioOS的强大之处。

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